Výběr matek je cílená selekce chovných (šlechtitelských) matek na základě žádoucích vlastností včelstva. Mezi nejdůležitější sledované znaky patří mírnost (klidné chování na díle), nerojavost, hygiena (vyklízení nemocného plodu), zimovatelnost, produktivita medu, odolnost vůči chorobám a dobré zdraví matky samotné. Systematický výběr vede k postupnému zlepšování chované populace.
Chovní včelaři vedou podrobné záznamy o vlastnostech jednotlivých včelstev a jejich potomků. Hodnocení probíhá standardizovaně podle metodik národních šlechtitelských programů – v Česku koordinuje hodnocení Výzkumný ústav včelařský a organizace Svaz chovatelů Apis mellifera bohemika. Chovní jedinci jsou označeni a jejich potomci jsou sledováni v dalších generacích.
Matky z pečlivě vybraných chovných linií se rozmnožují přeočkováním, plemenné trubce lze kontrolovat výběrem lokalit pro snubní let nebo instrumentálním oplodněním. Bez záměrného výběru matek se populace v průběhu generací vrací ke středním hodnotám – výsledky šlechtění je proto třeba udržovat každoroční selekcí a vyřazováním podprůměrných včelstev z reprodukce.